Nous voilà 15 ans après la fin de la conspiration mondiale dépeinte dans Deus Ex. Dans le chaos qui s'est ensuivi, une crise économique a frappé le monde de plein fouet. Désormais, les gouvernements corporatistes utilisent le terrorisme comme principal moyen de mener à bien leurs projets.

Quelques jours avant le début de Deus Ex: Invisible War, Alex D est brutalement tiré hors de son lit et amené en urgence à un aérodrome secret pour être éloigné de son environnement natal. Désormais confiné(e) à un centre d'entraînement de Seattle "pour son propre bien", Alex apprend que la ville de Chicago, son foyer, vient d'être complètement détruite lors d'une attaque terroriste nanotechnologique.

Les seuls fragments du passé d'Alex sont maintenant confinés au centre d'entraînement de Seattle : Billie Adams (une autre recrue de Chicago), deux étudiants issus du programme de Seattle et, comme toujours, la promesse floue que les mystérieux rites et épreuves de l'entraînement ne sont qu'un prémisse à une lucrative carrière de mercenaire corporatiste et d'espion. Mais, ces perspectives vont bientôt voler en éclats.
 

Alex Denton
. Appartenance : Académie Tarsus
. Age : 21 ans
. Sexe: Masculin
. Lieu de naissance: Chicago?

Dr. Leila Nassif
. Position: Coordinatrice, Centre d'entraînement avancé de Seattle
. Etat: En activité

 

Billie Adams
. Position: résidente du SOR, niveau 2, Centre de New Chicago
. Etat: En activité
 

NG Resonance
NG Resonance est la reine du boogie, une pop star virtuelle. Pour des millions d’adolescents, elle est le visage, la voix qu’ils adulent passionnément.

Tracer Tong
. Age : 65 ans
. Sexe : Masculin
. Lieu de naissance : Hong Kong
 

Lin May Chen
. Appartenance : Ordre
. Age : 25 ans
. Sexe : Féminin
. Lieu de naissance : Hong Kong

Pistolet Mako
Type de dégâts : balistique
Fonction secondaire : lampe-torche
Arme de poing standard.

Décodeur
Outil nanotechnologique multifonction qui peut être utilisé pour pirater des systèmes de sécurité (ex. digicodes, caméras et tourelles) et crocheter des serrures. Les tâches les plus complexes peuvent nécessiter plusieurs décodeurs.

Shotgun
Type de dégâts : Balistique
Fonction secondaire : lance-fumigènes
Arme anti-personnel.

Lance-roquettes
Tire une roquette à la puissance dévastatrice. Le mode tir secondaire permet au joueur de guider la roquette par le biais d’un affichage en vue subjective.
Fonction secondaire : Roquette lente, guider par le joueur (vue subjective).
Type de dégâts : explosifs
Portée de la visée automatique : longue
Type de munitions : Chargeur (5)

Arachnobombe
Un arachnorobot roulé en boule et en veille. Une fois lancé, il se déploie comme un arachnorobot classique, mais est alors au service du joueur. Les arachnorobot attaquent l’ennemi le plus proche.
Type de dégâts : IEM/Incapacitant

Arbalete
Arbalète traditionnelle sur tension améliorée, cet accélérateur tire un carreau électromagnétique. Il a tous les avantages et les inconvénients d’une arbalète classique. Ces carreaux sont enduits d’un poison non mortel dont les effets se décantent avec le temps.
Tir secondaire : visée intelligente
Type de dégâts : biotoxiques
Portée de la visée automatique : moyenne
Type de munitions : Chargeur (2)

Bruiteur
Une fois lancé, il émet des bruits pour faire diversion. S’il n’est pas endommagé, il s’autodétruit silencieusement au bout de 30 secondes.
Type de dégâts : Aucun
 

Grenade à concussion
Surtout efficace contre les unités organiques. Bruyante.
Type de dégâts : Explosifs
 

Jumelles
Des jumelles haute technologie pour voir plus loin.
Elles disposent de plusieurs niveaux de zoom et de portée.

Mitraillettes
Tir rapide et entièrement automatique.
Type de dégâts : Balistiques
Tir secondaire : Lance-grenades au phosphore
Portée : Moyenne

Couteau de combat
Poignard militaire utile pour trancher dans le vif.
Type de dégâts : Physiques
Portée : A bout portant.

Fusil à lunette
Arme à distance à très faible cadence de tir.
Tir secondaire : lunette intelligente
Type de dégâts : Balistiques
Portée : longue